Lembaga Biologi Molekuler Eijkman adalah sebuah lembaga riset kedokteran biologi di bawah pengawasan dan bertanggung jawab langsung ke Menteri Negara Riset dan Teknologi. Bila kita melihat asal muasalnya, pada tahun 1888 Lembaga ini dibangun sebagai laboratorium riset di bidang patologi dan bakteriologi, dimana Christiaan Eijkman diangkat sebagai direktur yang pertama; laboratorium ini kemudian terpilih sebagai Lembaga Eijkman pada tahun 1938, tetapi ditutup di tahun 1960-an. Lembaga Eijkman yang sekarang ini, beroperasi mulai di tahun 1993 dan diresmikan tahun 1995, adalah sebuah lembaga penelitian biologi sel dan molekul yang pada awalnya berfokus pada genetika kedokteran dan manusia, penyakit tropik yang menular, dan rekayasa biomolekul.

Laboratoriumnya menempati gedung bersejarah Lembaga Eijkman di Jakarta Pusat. Dari bangunan seluas 5.500 m², keseluruhannya telah selesai diperbaiki dan diperbaharui, walaupun penyelesaian akhir untuk menjadi sebuah lembaga yang baru masih dalam pengerjaan.

Salah seorang peneliti mempersiapkan alat centrifugator

Lembaga menerima dana pembangunan dari pemerintah Indonesia dan didukung oleh dana bantuan operasional dari industri dan hibah internasional. Kekuatan ilmiah Lembaga berawal dari kelompok penelitian genetika molekul manusia yang dipimpin oleh Profesor Sangkot Marzuki sebagai direkturnya yang pertama. Lembaga saat ini telah memiliki kurang lebih 75 ilmuwan, yang bekerja di enam bidang riset utama.